Upoznavanje naprednijih metoda molekularnog modeliranja. Pregled i usporedba metoda, računalnih programa, optimizacijskih tehnika. MO i VB teorije. HF jednadžbe, Roothanove jednadžbe. Osnovni skupovi. Kanonske molekularne orbitale, lokalizacija molekularnih orbitala. Elektronska korelacija. MC-SCF, perturbacijska teorija, konfiguracijska interakcija, metoda spregnutih grozdova. DFT. Populacijska analiza: Lowdinova, NBO i AIM metoda. NRT. Napredno pretraživanje plohe potencijalne enegije, stacionarne i infleksijske točke. IRC. Računanje termodinamičkih veličina. Pobuđena stanja. Vibracijski, elektronski, NMR spektri. Napredna solvatacija. Metode simuliranja sustava s velikim brojem atoma: Monte-Carlo metode i molekularna dinamika.
SHODI:
Objasniti temeljne metode i provesti račune koji uključuju korelaciju.
Pronaći i karakterizirati stacionarne i infleksijske točke te reakcijske staze na plohi potencijalne energije.
Provesti detaljnu analizu valne funkcije koristeći QTAIM i NBO metode.
Provesti računanje pobuđenih stanja i molekularnih spektara.
Demonstrirati poznavanje rada s naprednim računalnim metodama za molekularno modeliranje.
|
- A. R. Leach, Molecular Modelling, Principles and Applications, 2. izdanje, Longman, 2001.
- C. J. Cramer, Essentials of Computational Chemistry: Theories and Models, 2. izdanje, Wiley, 2004.
- F. Jensen, Introduction to Computational Chemistry, 2. izdanje, Wiley, 2007.
- E. G. Lewars, Computational chemistry. Introduction to the Theory and Applications of Molecular and Quantum Mechanics, 2nd edition, Springer, 2011.
- S. M. Bachrach, Computational Organic Chemistry, Wiley, 2007.
|
Pristupačnost
