Anketa

Na ovoj stranici trenutno nije odabrana niti jedna anketa!

Repozitorij

Repozitorij je prazan

Bioinformatika 1

Šifra: 92942
ECTS: 5.0
Nositelji: doc. dr. sc. Pavle Goldstein
Engleski jezik:

1,0,0

Nastava se odvija na hrvatskom jeziku u svim svojim elementima, a stranim studentima koji su pridruženi mješovitoj grupi nudi se mogućnost savladavanja predmeta pomoću dodatnih izravnih konzultacija s nastavnikom i asistentima na engleskom jeziku. Pri tome, nastavnik stranog studenta upućuje na odgovarajuću literaturu na engleskom jeziku te mu osigurava mogućnost polaganja predmeta na engleskom jeziku.
Opterećenje:

1. komponenta

Vrsta nastaveUkupno
Predavanja 45
* Opterećenje je izraženo u školskim satima (1 školski sat = 45 minuta)
Opis predmeta:
CILJ KOLEGIJA: Studente će se upoznati s osnovnim tehnikama u bioinformatici. Napredne tehnike bit će prikazane pomoću primjera, a naglasak će biti na praktičnim aspektima modeliranja - algoritamskim, računarskim i numeričkim.

NASTAVNI SADRŽAJI:
1. Uvod. Biološki nizovi i poravnavanje parova nizova. Supstitucijske matrice. Algoritmi za poravnavanje parova nizova. Markovljevi modeli. (4 tjedna)
2. Skriveni Markovljevi modeli. Viterbijev algoritam i varijante; forward, backward algoritam; profil familije. (4 tjedna)
3. Baum-Welchova optimizacija. Uvod u filogenetska stabla. Neighbour-joining algoritam. (4 tjedna)
Literatura:
1. semestar
Izborni predmet 1, 2, 3 - Redovni Studij - Matematička statistika

2. semestar Ne predaje se
Izborni predmet 1, 2, 3 - Redovni Studij - Matematička statistika

3. semestar
Izborni predmet 4, 5, 6, 7 - Redovni Studij - Matematička statistika

4. semestar Ne predaje se
Izborni predmet 4, 5, 6, 7 - Redovni Studij - Matematička statistika
Termini konzultacija:

SADRŽAJ

Link na stranicu kolegija: 


Obavijesti