Pristupačnost
Maja Novak
Fizički odsjek, Prirodoslovno-Matematički fakultet, Sveučilište u Zagrebu
Strateško odlučivanje kod stanične kemotaksije i veza sa samoorganizacijom
Srijeda/Wednesday 02.03.2022. u 14 h (c.t.)
Drage kolegice i kolege,
Drago mi je da mogu najaviti sljedeci Seminar Fizičkog odsjeka:
Dear colleagues,
I would like to invite you to the following Seminar of the Department of Physics:
srijeda/Wednesday 02.03.2022. u 14 h (c.t.)
Strateško odlučivanje kod stanične kemotaksije i veza sa samoorganizacijom
Maja Novak
Fizički odsjek, Prirodoslovno-Matematički fakultet, Sveučilište u Zagrebu
Bitno svojstvo bioloških sustava je obrada informacija o okolišu, kao i
skup strategija po kojima se sustav ponaša ovisno o tim informacijama.
Kako bi stanice pronašle hranu, izbjegle toksine i pronašle druge
stanice, one procjenjuju koncentraciju određenih molekula u okolini, te
korištenjem te informacije prilagođavaju svoje kretanje. Ovo svojstvo je
poznato kao kemotaksija. Da bismo proučavali staničnu kemotaksiju
razvili smo model temeljen na Bayesovom algoritmu za procjenu
koncentracije molekula i odabiru optimalne strategije za pronalazak
globalnog maksimuma te koncentracije. Model uzima u obzir šum koji je
prisutan pri vezivanju molekula na receptore stanice tijekom
kemotaksije, što smanjuje pouzdanost procjene koncentracije molekula kao
i njezinog gradijenta. Iz modela dobivamo da se pouzdanost procjene
gradijenta koncentracije povećava uzastopnim korištenjem Bayesovog
algoritma. Proučavanjem gornje granice pouzdanosti procjene odredili smo
efikasnost Bayesovog algoritma. Pokazali smo da stanice efikasno
pronalaze maksimum koncentracije ako odaberu smjer kretanja koji
maksimizira predviđenu informaciju o položaju tog maksimuma, dobivenu na
temelju povijesti zauzeća receptora na stanici. Osim kemotaksije,
također proučavamo samoorganizaciju koja je odgovorna za formiranje i
ispravno funkcioniranje diobenog vretena. U budućnosti planiramo
povezati gore spomenute principe informiranog odlučivanja i
samoorganizacije u biološkim sustavima, kako bismo opisali složenije
fenomene poput životnog ciklusa stanice.
Cjeloviti oglas je u prilogu./Formatted announcement is attached.
Lijep pozdrav / Best regards
Sanjin Benic i Damjan Pelc
Drage kolegice i kolege,
jedna nadopuna: seminar ce se odrzati kontaktno u F201, no biti ce omoguceno i pracenje putem zoom-a:
poveznica: https://zoom.us/j/8205066086
ID: 820 506 6086