1. komponenta

Vrsta nastave	Ukupno
Predavanja	45

* Opterećenje je izraženo u školskim satima (1 školski sat = 45 minuta)

CILJ KOLEGIJA: Studente će se upoznati s osnovnim tehnikama u bioinformatici. Napredne tehnike bit će prikazane pomoću primjera, a naglasak će biti na praktičnim aspektima modeliranja - algoritamskim, računarskim i numeričkim.

NASTAVNI SADRŽAJI:
Uvod. Biološki nizovi i poravnavanje parova nizova. Supstitucijske matrice. Algoritmi za poravnavanje parova nizova. Markovljevi modeli. (4 tjedna)
Skriveni Markovljevi modeli. Viterbijev algoritam i varijante; forward, backward algoritam; profil familije. (4 tjedna)
Baum - Welchova optimizacija. Uvod u filogenetska stabla. Neighbour - joining algoritam. (4 tjedna)

1. Biological sequence analysis, R. Durbin et al., CUP, 2001.
2. Introduction to Computational Biology: Maps, Sequences and Genomes, M. S. Waterman, Chapman & Hall, 1995.
3. Statistical Methods in Bioinformatics, W. J. Ewens, G. R. Grant, Springer Verlag, 2001.

Ostali izborni predmeti - Redovni Studij - Računarstvo i matematika
Vezani kolegiji A - Redovni Studij - Računarstvo i matematika

Ostali izborni predmeti - Redovni Studij - Računarstvo i matematika
Vezani kolegiji A - Redovni Studij - Računarstvo i matematika

Ostali izborni predmeti - Redovni Studij - Računarstvo i matematika
Vezani kolegiji A - Redovni Studij - Računarstvo i matematika

Ostali izborni predmeti - Redovni Studij - Računarstvo i matematika
Vezani kolegiji A - Redovni Studij - Računarstvo i matematika