Lucija Kanjer

Obrana će se održati U:

PONEDJELJAK, 07. srpanj 2025. godine u 12.00 sati

u dvorani BO-P1 soba 202, PMF, Ravnice 48, Zagreb

Disertacija nosi naslov:

Diversity of cyanobacteria in epibiotic microbial communities associated with sea turtles

Raznolikost cijanobakterija u epibiotskim mikrobnim zajednicama morskih kornjača

Povjerenstvo za obranu imenovano je u sastavu:

prof. dr. sc. Marija Gligora Udovič, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

dr. sc. Ines Sviličić Petrić, znan. savjetnica, Institut Ruđer Bošković, Zagreb

izv. prof. dr. sc. Petar Žutinić, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

Zamjena: izv. prof. dr. sc. Ana Bielen, Prehrambeno-biotehnološki fakultet, Zagreb

Mentor: izv. prof. dr. sc. Sunčica Bosak, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

Summary:

Cyanobacteria are key components of marine microbial ecosystems, yet their role in host-associated environments, such as the carapace of sea turtles, remains largely unexplored. The aim of this work is to provide the first detailed characterization of epibiotic cyanobacterial communities associated with sea turtles using 16S rRNA gene amplicon sequencing and cultivation of novel cyanobacterial strains. Cyanobacteria, while not dominant, were found to be consistently present in sea turtle carapace biofilm. The most abundant were filamentous cyanobacteria of the genus Rhodoploca and other members of the order Nodosilineales. Turtle age and size were the main drivers of cyanobacterial diversity. The cultivated strains of Salileptolyngbya and Leptothoe represent potentially newly discovered commensals of sea turtles. Strains belonging to more opportunistic species like Okeania and Spirulina were also cultivated. The results demonstrate the importance of combining traditional cultivation methods and DNA-metabarcoding to uncover hidden cyanobacterial diversity in the host microbiome, with new insights into marine microbial ecology and sea turtle biology.

Sažetak:

Cijanobakterije predstavljaju ključnu komponentu morskih mikrobnih ekosustava, ali njihova uloga u mikrobiomu životinja, kao što su mikrobne zajednice na oklopima morskih kornjača, ostaje uglavnom neistražena. Cilj ovog rada je detaljno karakterizirati zajednice cijanobakterija povezanih s morskim kornjačama pomoću sekvenciranja amplikona gena 16S rRNA i izolacije i uzgoja novih cijanobakterijskih sojeva. Utvrđeno je da su cijanobakterije, iako nisu dominantne, stalno prisutne u biofilmovima oklopa kornjače. Najzastupljenije su bile nitaste cijanobakterije iz roda Rhodoploca i ostali pripadnici reda Nodosilineales. Starost i veličina kornjače bili su glavni pokretači raznolikosti cijanobakterijske zajednice. Uzgojeni sojevi Salileptolyngbya i Leptothoe predstavljaju potencijalno novootkrivene komenzale morskih kornjača. Također su kultivirani sojevi koji pripadaju rodovima kao što su Okeania i Spirulina koji pripadaju više oportunističkim svojtama. Rezultati pokazuju važnost kombiniranja tradicionalnih metoda uzgoja i DNA-metabarkodiranja za otkrivanje skrivene raznolikosti cijanobakterija u mikrobiomu domaćina, te pridonose novim spoznajama u području morske mikrobne ekologije i biologije morskih kornjača.