Lovro Kavur

Obrana će se održati u:

UTORAK, 30. rujan 2025. godine u 11.00 sati

u dvorani ZMB SEMINAR, Biološki odsjek, PMF, Horvatovac 102 a, Zagreb

Disertacija nosi naslov:

Analiza funkcijskih skupina molekula karakterističnih za maligni pleuralni mezoteliom primjenom vibracijske spektroskopije

Analysis of functional groups of molecules characteristic for malignant pleural mesothelioma using vibrational spectroscopy

Povjerenstvo za obranu imenovano je u sastavu:

prof. dr. sc. Petra Korać, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

izv. prof. dr. sc. Lovorka Batelja Vuletić, dr. med., Medicinski fakultet, Zagreb

prof. dr. sc. Gordan Lauc, Farmaceutsko-biokemijski fakultet, Zagreb

Zamjena: prof. dr. sc. Slavko Gašparov, dr. med., Medicinski fakultet,  Zagreb

Mentori:

prof. dr. sc. Ozren Gamulin, Medicinski fakultet, Zagreb

prof. dr. sc. Sven Seiwerth, red. prof. u trajnom zvanju, Medicinski fakultet, Zagreb

Sažetak:

Maligni pleuralni mezoteliom je agresivan tumor pleure čiju dijagnozu i pravodobno liječenje često otežava histološka sličnost s normalnom pleurom, upalnim lezijama pleure i metastatskim adenokarcinomom pluća u pleuri. Cilj ovog istraživanja bio je identificirati vibracijske biljege karakteristične za maligni pleuralni mezoteliom kako bi se omogućila diferencijacija od ostalih stanja pleure. U tu svrhu primijenjena je infracrvena spektroskopija s Fourierovom transformacijom u kombinaciji s analizom glavnih komponenata za analizu spektra uzoraka pleuralnog tkiva. Na temelju prikupljenih spektara, razvijen je model konvolucijske neuronske mreže za klasifikaciju uzoraka. Rezultati su pokazali da su razlike u infracrvenim spektrima između uzoraka malignog pleuralnog mezotelioma, normalne pleure i ostalih patoloških stanja pleure izražene u području apsorpcije glikana, što je potvrdila analiza N-vezanih glikana tekućinskom kromatografijom ultra visoke djelotvornosti. Također, imunohistokemijski profil proteina BAP1 pokazao je da do razlike u glikanskom profilu dolazi zbog smanjene ekspresije ovog proteina i posljedično poremećene sinteze glikana. Zaključno, infracrvena spektroskopija s Fourierovom transformacijom u kombinaciji s algoritmima strojnog učenja omogućuje brzu, neinvazivnu i pouzdanu diferencijaciju patoloških stanja pleure a u kombinaciji s komplementarnim metodama pruža dublji uvod u biološku osnovu uočenih razlika izmđu zdravog i patološkog stanja pleure.(99 stranica, 18 slika, 3 tablice, 155 literaturnih navoda, jezik izvornika: Hrvatski)

Ključne riječi: maligni pleuralni mezoteliom /infracrvena spektroskopija sa Fourierovom transformacijom/vibracijski biomarkeri/ N-glikani/tekućinska kromatografija/BRCA – asocirani protein 1/analiza glavnih komponenata