BASTIEN LUCIEN JEAN PROUST - OBRANA DOKTORSKOG RADA

Naslov:

Human NME6 protein: subcellular localization, structure and function

(Unutarstanični smještaj, struktura i funkcija proteina NME6 u čovjeka)

Petak, 25. studenog 2022. godine u 13.00 sati

u dvorani Seminar 016, Geološki odsjek, Horvatovac 102a, Zagreb

Povjerenstvo za obranu imenovano je u sastavu:

Izv. prof. dr. sc. Maja Matulić, PMF Zagreb

Prof. dr. sc. Biljana Balen, PMF Zagreb

Prof. dr. sc. Uwe Schlattner, French National Institute of Health and Medical Research, Grenoble Alpes University, Francuska

Zamjena:  dr. sc. Helena Ćetković, viša znanstvena savjetnica, IRB Zagreb

Mentorica: Dr. sc. Maja Herak Bosnar, znanstvena savjetnica, IRB Zagreb

Sažetak:

Nucleoside diphosphate kinase (NDPK/NME/NM23) family of enzymes catalyze the transfer of gamma phosphate group from nucleoside triphosphates to nucleoside diphosphates. The family sparked interest after the discovery of metastasis suppressor activity of NME1, leading to a comprehensive characterization of Group I members (NME1-NME4). In contrast, the evolutionary ancient Group II members (NME5-NME9) are to date barely explored. We aimed to produce an extensive description of the human NME6 protein, by revealing its expression pattern, enzymatic activity, subcellular localization, quaternary structure and cellular function. Our results show the ubiquitous expression of NME6. We demonstrated a lack of enzymatic activity linked to oligomerization deficiency. We confirmed the mitochondrial localization and refined it to a matrix-facing protein, partially bound to the mitochondrial inner membrane, where NME6 interacts with RCC1L protein. Finally, we unraveled a negative impact of NME6 on mitochondrial respiration, possibly linked to the regulation of mitochondria-encoded protein expression.

Nukleozid difosfatske kinaze, (NDPK/NME/NM23), kataliziraju prijenos gama fosfata s nukleozid trifosfata na nukleozid difosfate. Ova obitelj enzima privukla je veliku pozornost nakon otkrića da je jedan od njenih članova, NME1, uključen u sprječavanje nastanka metastaza. To je dovelo do sveobuhvatnih istraživanja članova NME iz skupine I (od NME1 do NME4). Nasuprot tome, evolucijski „stariji“ članovi Grupe II (od NME5 do NME9) do danas su vrlo malo istraženi. Cilj ovog rada bio je detaljnije istražiti ljudski protein NME6, utvrditi njegovu ekspresiju, enzimsku aktivnosti, unutarstanični smještaj, kvarternu strukturu i stanične funkcije. Naši rezultati pokazuju sveprisutnu ekspresiju proteina NME6. Pokazali smo da NME6 ne stvara oligomere te da, u vezi s time, ne pokazuje ni enzimatsku aktivnost. Pokazali smo da je protein smješten u matriksu mitohondrija, vjerojatno djelomično vezan na unutarnju membranu, gdje stupa u interakciju s proteinom RCC1L. Konačno, otkrili smo negativan utjecaj pojačane ekspresije NME6 na stanično disanje, što je vjerojatno povezano s regulacijom ekspresije proteina kodiranih mitohondrijskom DNA.